二手大豆蛋白分離機分離機理，在流動相中加入親脂性離子，如烷基磺酸或季銨化合物，能在化學鍵合的反相柱上分離相反電荷的溶質離子。用UV作檢測器，并將這種方法稱為反相離子對色譜（RPIPC）。